MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	CTG	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013957	GCT	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013957	TTG	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013957	ATA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013957	GAG	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013957	ATC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013957	CTG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013957	TGC	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013957	TCTG	2	8	1865	1872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013957	GCA	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013957	GAC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013957	TCA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013957	GTTGAA	2	12	2311	2322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013957	T	6	6	2340	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013957	CTGT	2	8	2359	2366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013957	TTC	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013957	CAGA	2	8	2444	2451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013957	ATAAAA	2	12	2525	2536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013957	AATG	2	8	2537	2544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013957	AATT	2	8	2570	2577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013957	T	6	6	2576	2581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013957	A	6	6	2602	2607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013957	TG	3	6	2613	2618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013957	GAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013957	A	6	6	3209	3214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013957	A	6	6	3225	3230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013957	A	6	6	3324	3329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013957	A	9	9	3332	3340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013957	TA	3	6	3397	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013957	T	6	6	3563	3568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013957	GAT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013957	CCG	2	6	3615	3620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013957	ACA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013957	TC	3	6	3721	3726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013957	GCAG	2	8	3747	3754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013957	ATT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013957	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013957	GCC	2	6	3880	3885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013957	GTT	2	6	4154	4159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013957	ATT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013957	CCGGT	2	10	4294	4303	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013957	T	6	6	4556	4561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013957	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013957	AGG	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013957	A	6	6	4656	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013957	TAT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013957	ATT	3	9	5657	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013957	CCTG	2	8	7425	7432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013957	CCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013957	T	7	7	9196	9202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013957	TA	3	6	9213	9218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013957	CGC	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013957	GCG	2	6	9296	9301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013957	AATA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013957	AG	3	6	9885	9890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013957	TC	3	6	9929	9934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013957	GAA	2	6	10098	10103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013957	CAA	2	6	11449	11454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013957	TGG	2	6	11505	11510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013957	GC	3	6	11578	11583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013957	TC	3	6	14723	14728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013957	GGT	2	6	14769	14774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013957	AAT	2	6	14798	14803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013957	GCC	2	6	14815	14820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013957	CAA	2	6	14934	14939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013957	AGG	2	6	15674	15679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013957	GAA	2	6	15718	15723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013957	TCAT	2	8	15978	15985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013957	CAG	2	6	16030	16035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013957	TCC	2	6	16105	16110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013957	GAT	2	6	16146	16151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013957	TGG	2	6	16160	16165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013957	TAT	2	6	16240	16245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013957	GT	3	6	16270	16275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013957	GAC	2	6	16298	16303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013957	ATA	2	6	16304	16309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013957	TA	3	6	16598	16603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013957	TA	3	6	17313	17318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013957	AC	3	6	17354	17359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013957	TG	3	6	17403	17408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013957	ATGAGC	2	12	17410	17421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013957	A	8	8	17423	17430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013957	GCC	2	6	17459	17464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013957	CGT	2	6	17465	17470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013957	CGA	2	6	17474	17479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013957	GCT	2	6	17496	17501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013957	TGA	2	6	17516	17521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013957	C	10	10	17542	17551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_013957	AGC	2	6	17597	17602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013957	GTC	2	6	17916	17921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013957	CTT	2	6	17924	17929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013957	TGG	2	6	18183	18188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013957	ATTTC	2	10	18208	18217	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013957	TCA	2	6	18868	18873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013957	TGCC	2	8	18957	18964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013957	CAA	2	6	18991	18996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013957	TGT	2	6	19005	19010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013957	ATA	2	6	19029	19034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013957	AAT	2	6	19093	19098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013957	AT	3	6	19149	19154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013957	AATT	2	8	19157	19164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013957	GAA	2	6	19169	19174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013957	TGCCT	2	10	19853	19862	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013957	AGTGG	2	10	19879	19888	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013957	TAAA	2	8	19902	19909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013957	ATG	2	6	19974	19979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013957	ACCA	2	8	20031	20038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013957	GAA	2	6	20121	20126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013957	A	6	6	22188	22193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013957	GC	3	6	22213	22218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013957	CCG	2	6	22241	22246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013957	AGT	2	6	22286	22291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013957	T	8	8	22308	22315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013957	T	6	6	22317	22322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013957	TCC	2	6	22332	22337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013957	CGT	2	6	22345	22350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013957	AAG	2	6	22360	22365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013957	ATTG	2	8	22382	22389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013957	A	7	7	22401	22407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013957	TGT	2	6	22415	22420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013957	CTG	2	6	22449	22454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013957	CCAG	2	8	22494	22501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013957	CAG	2	6	22504	22509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013957	A	6	6	22544	22549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013957	T	6	6	23697	23702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013957	TC	3	6	23735	23740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013957	TGGC	2	8	23790	23797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013957	TTA	2	6	23850	23855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013957	TC	3	6	23904	23909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013957	GCCGG	2	10	23912	23921	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_013957	ACC	2	6	23984	23989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013957	AGA	3	9	24429	24437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013957	GAT	2	6	24511	24516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013957	AG	3	6	24545	24550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013957	CGG	2	6	24555	24560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013957	CCT	2	6	24615	24620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013957	AAAC	2	8	24684	24691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013957	AAT	2	6	24698	24703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013957	GAT	2	6	24745	24750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013957	CAG	2	6	24770	24775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013957	A	7	7	24794	24800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013957	T	6	6	24803	24808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013957	A	6	6	24814	24819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013957	TAA	2	6	24824	24829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013957	TAT	2	6	24841	24846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013957	AAAC	2	8	24903	24910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013957	GGAT	2	8	24966	24973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013957	TCA	2	6	24982	24987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013957	GCG	2	6	25023	25028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013957	CAA	2	6	25090	25095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013957	CGCC	2	8	25679	25686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_013957	A	8	8	25829	25836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013957	GAA	2	6	25867	25872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013957	C	6	6	25903	25908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_013957	TTA	2	6	25924	25929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013957	TGA	2	6	25969	25974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013957	CTTA	2	8	25981	25988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_013957	CAA	2	6	25998	26003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_013957	AT	3	6	26004	26009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013957	GAAAG	2	10	26153	26162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013957	A	6	6	26188	26193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013957	ATT	2	6	26225	26230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013957	TACTGA	2	12	26231	26242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_013957	CAA	2	6	26307	26312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_013957	TCA	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_013957	GCA	2	6	26433	26438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_013957	CAT	2	6	26487	26492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_013957	A	6	6	26496	26501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013957	GCGT	2	8	26512	26519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_013957	ATG	3	9	26536	26544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013957	TGC	2	6	26636	26641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_013957	A	6	6	26675	26680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013957	TCGA	2	8	26756	26763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_013957	TGCAG	2	10	26794	26803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_013957	AATGAA	2	12	26914	26925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013957	A	6	6	26992	26997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013957	CCG	2	6	27026	27031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178	NC_013957	T	6	6	27066	27071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_013957	T	7	7	27207	27213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013957	CTTTTA	2	12	27225	27236	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
181	NC_013957	TAT	2	6	27247	27252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013957	TAA	2	6	27253	27258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013957	GA	3	6	27284	27289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013957	GA	3	6	27328	27333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013957	T	7	7	27353	27359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013957	CT	3	6	27418	27423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_013957	C	6	6	27449	27454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
188	NC_013957	CAT	2	6	27519	27524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_013957	TACT	2	8	27541	27548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
190	NC_013957	CAT	2	6	27589	27594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_013957	AGTTA	2	10	27602	27611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013957	GAA	2	6	27636	27641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013957	CAT	2	6	27653	27658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_013957	AAT	2	6	27679	27684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_013957	A	6	6	27726	27731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013957	T	6	6	27736	27741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013957	GA	3	6	27783	27788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013957	ATG	2	6	27790	27795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
199	NC_013957	GGA	2	6	27834	27839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_013957	TG	3	6	28227	28232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
211	NC_013957	AAT	2	6	28234	28239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.